Message d'erreur de GeoNetWork

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Message d'erreur de GeoNetWork

Pascal Kabore
Bonjour

Je suis le responsable de la gestion du GéoRepertoire de l'Autorité du
Bassin du Niger regroupant 9 pays de l'Afrique de l'Ouest et Centrale. Il a
été developpé avec GeoNetWork 2.1 en 2007 avec l'appui de l'Université de
Sherbrooke du Canada et a été fonctionnel jusqu'en 2011.
Mais depuis de debut de l'année 2012 il n'est pas fonctionne pour cause de
message d'erreur dont je joins le  log.
C'est une application qui est appréciée par les utilisateurs et dont je
souhaiterais le remettre en ligne dès que possible.
J'attends vos conseils et vos aides pour le remettre en marche et par la
suite le faire migrer à la nouvelle version 2.6

Voici le message d'erreur quand je fais une recherche ou si je tente de me
connecter:

Erreur

L'opération demandée ne peut être réalisée.

NullPointerException :


Très cordialement,


--
KABORE Pascal
Spécialiste Bases de Données et SIG
Observatoire du Bassin du Niger
Autorité du Bassin du Niger (ABN)
BP: 729, Niamey - Rép. du NIGER
Tél.: +227 20 31 52 39
Fax.: +227 20 73 62 74 / 20 72 42 08
GSM: +227 94 24 08 86

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[hidden email]
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geonetwork.zip (526K) Download Attachment
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Re: Message d'erreur de GeoNetWork

Francois Prunayre
Bonjour Pascal,

2012-12-12 19:23:45,799 DEBUG [geonetwork.datamanager] - record createDate
(2009-01-30T06:16:59)
2012-12-12 19:23:46,837 ERROR [jeeves.engine] - Raised exception while
starting appl handler. Skipped.
2012-12-12 19:23:46,838 ERROR [jeeves.engine] -    Handler   :
org.fao.geonet.Geonetwork
2012-12-12 19:23:46,838 ERROR [jeeves.engine] -    Exception :
org.apache.lucene.store.LockObtainFailedException: Lock obtain timed out:
SimpleFSLock@E
:\GeoNetWork_new\geonetwork_abn\web\geonetwork\WEB-INF\lucene\write.lock
2012-12-12 19:23:46,838 ERROR [jeeves.engine] -    Message   : Lock obtain
timed out: SimpleFSLock@E
:\GeoNetWork_new\geonetwork_abn\web\geonetwork\WEB-INF\lucene\write.lock
2012-12-12 19:23:46,838 ERROR [jeeves.engine] -    Stack     :
org.apache.lucene.store.LockObtainFailedException: Lock obtain timed out:
SimpleFSLock@E
:\GeoNetWork_new\geonetwork_abn\web\geonetwork\WEB-INF\lucene\write.lock
at org.apache.lucene.store.Lock.obtain(Lock.java:85)
at
org.apache.lucene.index.DirectoryIndexReader.acquireWriteLock(DirectoryIndexReader.java:250)
at org.apache.lucene.index.IndexReader.deleteDocument(IndexReader.java:725)
at org.apache.lucene.index.IndexReader.deleteDocuments(IndexReader.java:761)
at org.fao.geonet.kernel.search.SearchManager.delete(SearchManager.java:291)


semble indiquer qu'un verrou est présent sur l'index (Lock obtain timed
out:). Essayer de supprimer le
fichier E:\GeoNetWork_new\geonetwork_abn\web\geonetwork\WEB-INF\lucene\write.lock
et relancer le catalogue. Vous pouvez également tenter de supprimer l'index
(E:\GeoNetWork_new\geonetwork_abn\web\geonetwork\WEB-INF\lucene) et
relancer. L'index sera créé au lancement.

Salutations.

Francois






Le 13 décembre 2012 10:18, Pascal Kabore <[hidden email]> a écrit :

> Bonjour
>
> Je suis le responsable de la gestion du GéoRepertoire de l'Autorité du
> Bassin du Niger regroupant 9 pays de l'Afrique de l'Ouest et Centrale. Il a
> été developpé avec GeoNetWork 2.1 en 2007 avec l'appui de l'Université de
> Sherbrooke du Canada et a été fonctionnel jusqu'en 2011.
> Mais depuis de debut de l'année 2012 il n'est pas fonctionne pour cause de
> message d'erreur dont je joins le  log.
> C'est une application qui est appréciée par les utilisateurs et dont je
> souhaiterais le remettre en ligne dès que possible.
> J'attends vos conseils et vos aides pour le remettre en marche et par la
> suite le faire migrer à la nouvelle version 2.6
>
> Voici le message d'erreur quand je fais une recherche ou si je tente de me
> connecter:
>
> Erreur
>
> L'opération demandée ne peut être réalisée.
>
> NullPointerException :
>
>
> Très cordialement,
>
>
> --
> KABORE Pascal
> Spécialiste Bases de Données et SIG
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>
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Re: Message d'erreur de GeoNetWork

Francois Prunayre
Bonjour,


Le 16 décembre 2012 12:02, Pascal Kabore <[hidden email]> a écrit :

> Bonjour
>
> J'ai appliqué vos conseils et cela marche parfaitement. Je vous remercie
> infiniment.
> Pouvez vous m'indiquer comment mettre à jour la version de notre
> GeoNetWork, c'est à dire passer de la version 2.1 à la version 2.6 de
> GeoNetWork.
>

Il y a plusieurs approches:
1) tenter une migration de la base de données manuellement à partir des
scripts de migration [1]
2) exporter les métadonnées et les importer

L'option 2) peut être plus rapide si vous n'avez pas beaucoup de
groupes/utilisateurs

Une version 2.8 de GeoNetwork est en cours de finalisation, donc vous
devriez partir de cette version [2] plutôt qu'une 2.6.

Salutations.

Francois

[1]
https://github.com/geonetwork/core-geonetwork/tree/2.8.x/web/src/main/webapp/WEB-INF/classes/setup/sql/migrate
[2]
http://sourceforge.net/projects/geonetwork/files/GeoNetwork_unstable_development_versions/v2.8.0RC2/


>
> Très cordialement,
>
>
> Le 16 décembre 2012 10:41, Francois Prunayre <[hidden email]> a
> écrit :
>
> Bonjour Pascal,
>>
>> 2012-12-12 19:23:45,799 DEBUG [geonetwork.datamanager] - record
>> createDate (2009-01-30T06:16:59)
>> 2012-12-12 19:23:46,837 ERROR [jeeves.engine] - Raised exception while
>> starting appl handler. Skipped.
>> 2012-12-12 19:23:46,838 ERROR [jeeves.engine] -    Handler   :
>> org.fao.geonet.Geonetwork
>> 2012-12-12 19:23:46,838 ERROR [jeeves.engine] -    Exception :
>> org.apache.lucene.store.LockObtainFailedException: Lock obtain timed out:
>> SimpleFSLock@E
>> :\GeoNetWork_new\geonetwork_abn\web\geonetwork\WEB-INF\lucene\write.lock
>> 2012-12-12 19:23:46,838 ERROR [jeeves.engine] -    Message   : Lock
>> obtain timed out: SimpleFSLock@E
>> :\GeoNetWork_new\geonetwork_abn\web\geonetwork\WEB-INF\lucene\write.lock
>> 2012-12-12 19:23:46,838 ERROR [jeeves.engine] -    Stack     :
>> org.apache.lucene.store.LockObtainFailedException: Lock obtain timed out:
>> SimpleFSLock@E
>> :\GeoNetWork_new\geonetwork_abn\web\geonetwork\WEB-INF\lucene\write.lock
>>  at org.apache.lucene.store.Lock.obtain(Lock.java:85)
>> at
>> org.apache.lucene.index.DirectoryIndexReader.acquireWriteLock(DirectoryIndexReader.java:250)
>>  at
>> org.apache.lucene.index.IndexReader.deleteDocument(IndexReader.java:725)
>> at
>> org.apache.lucene.index.IndexReader.deleteDocuments(IndexReader.java:761)
>>  at
>> org.fao.geonet.kernel.search.SearchManager.delete(SearchManager.java:291)
>>
>>
>> semble indiquer qu'un verrou est présent sur l'index (Lock obtain timed
>> out:). Essayer de supprimer le
>> fichier E:\GeoNetWork_new\geonetwork_abn\web\geonetwork\WEB-INF\lucene\write.lock
>> et relancer le catalogue. Vous pouvez également tenter de supprimer
>> l'index (E:\GeoNetWork_new\geonetwork_abn\web\geonetwork\WEB-INF\lucene) et
>> relancer. L'index sera créé au lancement.
>>
>> Salutations.
>>
>> Francois
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>> Le 13 décembre 2012 10:18, Pascal Kabore <[hidden email]> a écrit :
>>
>>> Bonjour
>>>
>>> Je suis le responsable de la gestion du GéoRepertoire de l'Autorité du
>>> Bassin du Niger regroupant 9 pays de l'Afrique de l'Ouest et Centrale.
>>> Il a
>>> été developpé avec GeoNetWork 2.1 en 2007 avec l'appui de l'Université de
>>> Sherbrooke du Canada et a été fonctionnel jusqu'en 2011.
>>> Mais depuis de debut de l'année 2012 il n'est pas fonctionne pour cause
>>> de
>>> message d'erreur dont je joins le  log.
>>> C'est une application qui est appréciée par les utilisateurs et dont je
>>> souhaiterais le remettre en ligne dès que possible.
>>> J'attends vos conseils et vos aides pour le remettre en marche et par la
>>> suite le faire migrer à la nouvelle version 2.6
>>>
>>> Voici le message d'erreur quand je fais une recherche ou si je tente de
>>> me
>>> connecter:
>>>
>>> Erreur
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>>> L'opération demandée ne peut être réalisée.
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>>> NullPointerException :
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>>>
>>> Très cordialement,
>>>
>>>
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>>
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Re: Message d'erreur de GeoNetWork

Mlecoeuvre
Bonjour,
ce post m’intéresse grandement car je recherche des informations sur la migration du catalogue geonetwork vers de nouvelles versions.
Ainsi une simple export import suffit pour transférer la totalités des fiches de métadonnées (étant donnée que je n'est qu'un seul groupe d'utilisateur)
Mais pour ce qui est de transférer les configurations et personnalisation apporter aux différent fichiers XML,CSW, ....
avez vous des informations à partager?
j'ai bien trouver ces explications:
http://okacom.upfronthosting.co.za/geonetwork/docs/eng/users/quickstartguide/migration/index.html
mais j'ai du mal à tout saisir.
Cordialment
Mireille Lecoeuvre
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Re: Message d'erreur de GeoNetWork

alassane
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In reply to this post by Pascal Kabore
Bonjour, j'ai un message d'erreur avec mon geonetwork 3.0.2.
Raised exception while starting the application. Fix the error and restart.




Exception

java.lang.RuntimeException: org.apache.lucene.store.LockObtainFailedException: Lock obtain timed out: NativeFSLock@/usr/local/geonetwork/web/geonetwork/WEB-INF/data/index/taxonomy/write.lock: java.nio.channels.OverlappingFileLockException


Message

org.apache.lucene.store.LockObtainFailedException: Lock obtain timed out: NativeFSLock@/usr/local/geonetwork/web/geonetwork/WEB-INF/data/index/taxonomy/write.lock: java.nio.channels.OverlappingFileLockException


Handler

org.fao.geonet.Geonetwork


Stack

java.lang.RuntimeException: org.apache.lucene.store.LockObtainFailedException: Lock obtain timed out: NativeFSLock@/usr/local/geonetwork/web/geonetwork/WEB-INF/data/index/taxonomy/write.lock: java.nio.channels.OverlappingFileLockException
        at org.fao.geonet.kernel.search.index.LuceneIndexLanguageTracker.lazyInit(LuceneIndexLanguageTracker.java:68)
        at org.fao.geonet.kernel.search.index.LuceneIndexLanguageTracker.acquire(LuceneIndexLanguageTracker.java:157)
        at org.fao.geonet.kernel.search.SearchManager.getIndexReader(SearchManager.java:1398)
        at org.fao.geonet.kernel.search.SearchManager.getNewIndexReader(SearchManager.java:1402)
        at org.fao.geonet.kernel.search.SearchManager.getDocsChangeDate(SearchManager.java:1057)
        at org.fao.geonet.kernel.DataManager.init(DataManager.java:239)
        at org.fao.geonet.Geonetwork.start(Geonetwork.java:378)
        at jeeves.server.JeevesEngine.initAppHandler(JeevesEngine.java:452)
        at jeeves.server.JeevesEngine.init(JeevesEngine.java:173)
        at jeeves.server.sources.http.JeevesServlet.init(JeevesServlet.java:82)
        at javax.servlet.GenericServlet.init(GenericServlet.java:158)
        at org.apache.catalina.core.StandardWrapper.initServlet(StandardWrapper.java:1284)
        at org.apache.catalina.core.StandardWrapper.loadServlet(StandardWrapper.java:1197)
        at org.apache.catalina.core.StandardWrapper.load(StandardWrapper.java:1087)
        at org.apache.catalina.core.StandardContext.loadOnStartup(StandardContext.java:5210)
        at org.apache.catalina.core.StandardContext.startInternal(StandardContext.java:5493)
        at org.apache.catalina.util.LifecycleBase.start(LifecycleBase.java:150)
        at org.apache.catalina.manager.ManagerServlet.start(ManagerServlet.java:1291)
        at org.apache.catalina.manager.HTMLManagerServlet.start(HTMLManagerServlet.java:694)
        at org.apache.catalina.manager.HTMLManagerServlet.doPost(HTMLManagerServlet.java:217)
        at javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:646)
        at javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:727)
        at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter(ApplicationFilterChain.java:303)
        at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter(ApplicationFilterChain.java:208)
        at org.apache.catalina.filters.CsrfPreventionFilter.doFilter(CsrfPreventionFilter.java:213)
        at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter(ApplicationFilterChain.java:241)
        at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter(ApplicationFilterChain.java:208)
        at org.apache.tomcat.websocket.server.WsFilter.doFilter(WsFilter.java:52)
        at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter(ApplicationFilterChain.java:241)
        at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter(ApplicationFilterChain.java:208)
        at org.apache.catalina.filters.SetCharacterEncodingFilter.doFilter(SetCharacterEncodingFilter.java:108)
        at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter(ApplicationFilterChain.java:241)
        at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter(ApplicationFilterChain.java:208)
        at org.apache.catalina.core.StandardWrapperValve.invoke(StandardWrapperValve.java:220)
        at org.apache.catalina.core.StandardContextValve.invoke(StandardContextValve.java:122)
        at org.apache.catalina.authenticator.AuthenticatorBase.invoke(AuthenticatorBase.java:610)
        at org.apache.catalina.core.StandardHostValve.invoke(StandardHostValve.java:171)
        at org.apache.catalina.valves.ErrorReportValve.invoke(ErrorReportValve.java:102)
        at org.apache.catalina.valves.AccessLogValve.invoke(AccessLogValve.java:950)
        at org.apache.catalina.core.StandardEngineValve.invoke(StandardEngineValve.java:116)
        at org.apache.catalina.connector.CoyoteAdapter.service(CoyoteAdapter.java:408)
        at org.apache.coyote.ajp.AjpProcessor.process(AjpProcessor.java:193)
        at org.apache.coyote.AbstractProtocol$AbstractConnectionHandler.process(AbstractProtocol.java:607)
        at org.apache.tomcat.util.net.JIoEndpoint$SocketProcessor.run(JIoEndpoint.java:314)
        at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1145)
        at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:615)
        at org.apache.tomcat.util.threads.TaskThread$WrappingRunnable.run(TaskThread.java:61)
        at java.lang.Thread.run(Thread.java:745)
Caused by: org.apache.lucene.store.LockObtainFailedException: Lock obtain timed out: NativeFSLock@/usr/local/geonetwork/web/geonetwork/WEB-INF/data/index/taxonomy/write.lock: java.nio.channels.OverlappingFileLockException
        at org.apache.lucene.store.Lock.obtain(Lock.java:89)
        at org.apache.lucene.index.IndexWriter.<init>(IndexWriter.java:724)
        at org.apache.lucene.facet.taxonomy.directory.DirectoryTaxonomyWriter.openIndexWriter(DirectoryTaxonomyWriter.java:265)
        at org.apache.lucene.facet.taxonomy.directory.DirectoryTaxonomyWriter.<init>(DirectoryTaxonomyWriter.java:192)
        at org.apache.lucene.facet.taxonomy.directory.DirectoryTaxonomyWriter.<init>(DirectoryTaxonomyWriter.java:315)
        at org.apache.lucene.facet.taxonomy.directory.DirectoryTaxonomyWriter.<init>(DirectoryTaxonomyWriter.java:332)
        at org.fao.geonet.kernel.search.index.TaxonomyIndexTracker.init(TaxonomyIndexTracker.java:46)
        at org.fao.geonet.kernel.search.index.TaxonomyIndexTracker.<init>(TaxonomyIndexTracker.java:40)
        at org.fao.geonet.kernel.search.index.LuceneIndexLanguageTracker.lazyInit(LuceneIndexLanguageTracker.java:59)
        ... 47 more
Caused by: java.nio.channels.OverlappingFileLockException
        at sun.nio.ch.SharedFileLockTable.checkList(FileLockTable.java:255)
        at sun.nio.ch.SharedFileLockTable.add(FileLockTable.java:152)
        at sun.nio.ch.FileChannelImpl.tryLock(FileChannelImpl.java:1088)
        at java.nio.channels.FileChannel.tryLock(FileChannel.java:1154)
        at org.apache.lucene.store.NativeFSLock.obtain(NativeFSLockFactory.java:169)
        at org.apache.lucene.store.Lock.obtain(Lock.java:96)
        ... 55 more
 
Je n'arrive à le résoudre, merci de me guider.